AAV衣壳产量预测模型用户指南

AAV ViaPredictor 是赛业生物与清华珠三角研究院人工智能创新中心联合开发的一款基于 AI 模型的 AAV 产量预测工具。该工具通过整合多维度特征数据与深度学习框架，实现对不同血清型载体的产量预测，为基因治疗药物的研发与生产提供产量优化支持。

工具接收 AAV2 与 AAV9 两种血清型的碱基序列，以此完成产量预测，具体应用条件如下：

图 1. 操作示意图，其中输入的片段只能为碱基序列

• 突变支持范围：仅限在野生型 587–588 氨基酸位点间插入 21–30 个碱基（7–10 个氨基酸）的变体。
• 参考序列：野生型 561–592 位点序列 DEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGN^RQAAT（^ 标识为 587–588 插入位点）。
• 插入结构：自动添加 N 端酶切序列 TG 和 C 端酶切序列 GLS，形成 TG~GLS 格式，其中 ~ 表示输入的片段。

• 替换突变：野生型 586–588 位点 SAQ 序列的氨基酸替换，其中 SAQ 的碱基为 AGTGCCCAA。
• 插入突变：野生型 588–589 位点间插入 21 个碱基（7 个氨基酸）的变体。
• 参考序列：野生型 562–593 位点序列 NEEEIKTTNPVATESYGQVATNHQSAQ^AQAQT（^ 标识为 588–589 插入位点）。
• 插入要求：严格限定 7 个氨基酸长度的插入片段。

注意：需要输入的是碱基序列，而不是氨基酸序列。

1.选择血清型。AAV2 输入插入片段；AAV9 输入前 9 个碱基的替换段与后 21 个碱基的插入段，共 30 nt。

2.粘贴 Fasta 序列或一行一条碱基序列，也可使用案例数据、选择 .fasta / .fa 文件，或点击"格式化为 Fasta"。

3.在解析预览中检查每条序列。绿色勾表示通过，红色文字显示具体原因；修改后实时重新检查。

4.点击"预测"，在输入下方查看任务状态、结果表与产量对比图。完成后可排序或下载全部 CSV 结果。

5.登录状态下提交的任务可在"历史"中查看和删除。"查看"会回填血清型与序列，并在同页展示该任务结果。

结果为一个数据表：名称为输入的序列标识，预测分值为模型输出（已使用 log2 缩放），分值越高代表产量越高。

单次最多 20 条。

登录后的预测会出现在「历史」中，可随时查看或删除；未登录的预测不进入任何人的历史列表。

删除后该记录及其序列不可恢复。