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小鼠
Fcgbpl1 - Fc fragment of IgG binding protein like 1
别称:
9530053A07Rik
|
FCGBP
基础信息
物种序列比对
转录本 & 蛋白质
基因表达量
蛋白相互作用
相关模型
文献报道
预测其在细胞外基质和细胞外空间中具有活性。与人类 FCGBP(Fc gamma binding protein)为直系同源物。[由基因组资源联盟提供,2025 年 4 月]
相关ID:
NCBI: 319482
|
ENSEMBL: ENSMUSG00000078776
基础信息
基因类型
NCBI
转录本
外显子
基因长度
分子量
相关模型
参考文献
Protein-coding
319482
1
20
35346 bp
--
0
2
Fcgbpl1遗传学信息(+)
GRCm39
物种序列比对
对比当前基因在大鼠、小鼠和人类中的同源基因的差异:
基因长度:基因所在染色体及和该基因所含碱基数;
转录本长度:基因的MANE (The Matched Annotation from the NCBI and EMBL-EBI)转录本ID及其对应的序列长度;
蛋白质长度:列出了基因的MANE蛋白质ID及其长度信息;
外显子数量:基因MANE转录本包含外显子数量;
CDS同源性:编码MANE蛋白的CDS剪接序列相似性比较,以人类、小鼠或大鼠序列为基准(100%);
蛋白质同源性:MANE蛋白的氨基酸序列相似性比较,人类、小鼠或大鼠序列为基准(100%)
数据来源于:NCBI、ALLIANCE
转录本 & 蛋白质
当前基因的转录本概览,可切换表格和图形展示:
表格:统计对应转录本序列长度、外显子个数、CDS(编码区)长度、相关联的蛋白质序列ID、蛋白质序列长度等信息;
图形:对内含子、外显子以及UTR(非编码区)和CDS(编码区)进行直观展示。
MANE Select: 人类基因组中 NCBI 与 EBI 一致定义的代表性转录本
MANE Plus Clinical: 人类基因组中,在临床报告中具有重要意义的补充转录本
RefSeq Select: NCBI 挑选出的具有代表性的参考转录本(主要用于小鼠或其他无 MANE 标签的物种)
数据来源:NCBI
基因表达量
当前基因在各类组织及细胞中的RNA表达水平,允许用户根据组织类型、具体的表达量数值或字母顺序进行排序。
数据来源:NCBI
蛋白相互作用
当前基因存在相互作用的基因,包括以下内容:
作用蛋白、靶蛋白:区分互作链中的上游作用蛋白与下游靶蛋白;
调控方式:四种调控类型:
[
] 上调
[
] 下调
[
] 复合体形成
[
] 未知
实线代表直接作用,虚线表示间接作用;
作用蛋白、靶蛋白:区分互作链中的上游作用蛋白与下游靶蛋白;
调控细节:表明互作后蛋白数量或活性的变化;
作用机制:阐述互作导致的功能转变;
氨基酸残基:指出参与互作的特定氨基酸残基,并指明研究物种、组织或细胞;
参考文献:汇总并展示相关互作研究的报道文献及其概览,并指明研究物种、组织或细胞;
分值:通过分值量化互作紧密程度,分数越高,联系越紧密。
数据来源:Signor、PubMed
相关模型
当前基因相关的小鼠模型,点击模型名称,可查看模型详情。
数据来源:MGI、Cyagen
文献报道
当前基因最为密切相关的文献,可按年份、文献类型筛选,并可根据影响因子排序。
数据来源:Uniprot、PubMed