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小鼠
Actc1 - actin, alpha, cardiac muscle 1
别称:
Actc-1
基础信息
物种序列比对
转录本 & 蛋白质
基因表达量
蛋白相互作用
相关模型
文献报道
预测其具有 ATP 结合活性、微丝马达活性及肌球蛋白结合活性。该基因作用于或参与多个过程,包括心肌组织形态发生、细胞运动涉及的细胞质肌动蛋白收缩以及肌原纤维组装。定位于 I 带。在谷氨酸能突触中发挥活性。表达于多个结构,包括消化系统、中枢神经系统、泌尿生殖系统、心脏和肌肉组织。用于研究扩张型心肌病 1R 型。该基因的人类同源物与心房中隔缺损 5 型、扩张型心肌病、扩张型心肌病 1R 型及肥厚型心肌病 11 型相关。与人类 ACTC1(actin alpha cardiac muscle 1)同源。[由基因组资源联盟提供,2025 年 7 月]
相关ID:
NCBI: 11464
|
ENSEMBL: ENSMUSG00000068614
|
UNIPROT: P68033
基础信息
基因类型
NCBI
转录本
外显子
基因长度
分子量
相关模型
参考文献
Protein-coding
11464
1
7
5594 bp
42.02
5
11
Actc1遗传学信息(-)
GRCm39
物种序列比对
对比当前基因在大鼠、小鼠和人类中的同源基因的差异:
基因长度:基因所在染色体及和该基因所含碱基数;
转录本长度:基因的MANE (The Matched Annotation from the NCBI and EMBL-EBI)转录本ID及其对应的序列长度;
蛋白质长度:列出了基因的MANE蛋白质ID及其长度信息;
外显子数量:基因MANE转录本包含外显子数量;
CDS同源性:编码MANE蛋白的CDS剪接序列相似性比较,以人类、小鼠或大鼠序列为基准(100%);
蛋白质同源性:MANE蛋白的氨基酸序列相似性比较,人类、小鼠或大鼠序列为基准(100%)
数据来源于:NCBI、ALLIANCE
转录本 & 蛋白质
当前基因的转录本概览,可切换表格和图形展示:
表格:统计对应转录本序列长度、外显子个数、CDS(编码区)长度、相关联的蛋白质序列ID、蛋白质序列长度等信息;
图形:对内含子、外显子以及UTR(非编码区)和CDS(编码区)进行直观展示。
MANE Select: 人类基因组中 NCBI 与 EBI 一致定义的代表性转录本
MANE Plus Clinical: 人类基因组中,在临床报告中具有重要意义的补充转录本
RefSeq Select: NCBI 挑选出的具有代表性的参考转录本(主要用于小鼠或其他无 MANE 标签的物种)
数据来源:NCBI
基因表达量
当前基因在各类组织及细胞中的RNA表达水平,允许用户根据组织类型、具体的表达量数值或字母顺序进行排序。
数据来源:NCBI
蛋白相互作用
当前基因存在相互作用的基因,包括以下内容:
作用蛋白、靶蛋白:区分互作链中的上游作用蛋白与下游靶蛋白;
调控方式:四种调控类型:
[
] 上调
[
] 下调
[
] 复合体形成
[
] 未知
实线代表直接作用,虚线表示间接作用;
作用蛋白、靶蛋白:区分互作链中的上游作用蛋白与下游靶蛋白;
调控细节:表明互作后蛋白数量或活性的变化;
作用机制:阐述互作导致的功能转变;
氨基酸残基:指出参与互作的特定氨基酸残基,并指明研究物种、组织或细胞;
参考文献:汇总并展示相关互作研究的报道文献及其概览,并指明研究物种、组织或细胞;
分值:通过分值量化互作紧密程度,分数越高,联系越紧密。
数据来源:Signor、PubMed
相关模型
当前基因相关的小鼠模型,点击模型名称,可查看模型详情。
数据来源:MGI、Cyagen
文献报道
当前基因最为密切相关的文献,可按年份、文献类型筛选,并可根据影响因子排序。
数据来源:Uniprot、PubMed