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CFTR - CF Transmembrane Conductance Regulator
别称:
ABC35
|
ABCC7
|
CF
|
CFTR/MRP
|
MRP7
|
TNR-CFTR
|
dJ760C5.1
基础信息
物种序列比对
疾病 & 突变
转录本 & 蛋白质
基因表达量
蛋白相互作用
相关模型
靶点药物
文献报道
This gene encodes a member of the ATP-binding cassette (ABC) transporter superfamily. The encoded protein functions as a chloride channel, making it unique among members of this protein family, and controls ion and water secretion and absorption in epithelial tissues. Channel activation is mediated by cycles of regulatory domain phosphorylation, ATP-binding by the nucleotide-binding domains, and ATP hydrolysis. Mutations in this gene cause cystic fibrosis, the most common lethal genetic disorder in populations of Northern European descent. The most frequently occurring mutation in cystic fibrosis, DeltaF508, results in impaired folding and trafficking of the encoded protein. Multiple pseudogenes have been identified in the human genome. [provided by RefSeq, Aug 2017]
相关ID:
NCBI: 1080
|
ENSEMBL: ENSG00000001626
|
HGNC: 1884
|
UNIPROT: P13569
|
OMIM: 602421
基础信息
基因类型
NCBI
转录本
外显子
基因长度
分子量
基因突变
相关疾病
相关模型
参考文献
Protein-coding
1080
1
27
188641 bp
168.14
5604
致病: 1028
可能致病: 306
可能良性: 1403
良性: 112
不确定: 2755
24
24
138
CFTR遗传学信息(+)
GRCh38
物种序列比对
对比当前基因在大鼠、小鼠和人类中的同源基因的差异:
基因长度:基因所在染色体及和该基因所含碱基数;
转录本长度:基因的MANE (The Matched Annotation from the NCBI and EMBL-EBI)转录本ID及其对应的序列长度;
蛋白质长度:列出了基因的MANE蛋白质ID及其长度信息;
外显子数量:基因MANE转录本包含外显子数量;
CDS同源性:编码MANE蛋白的CDS剪接序列相似性比较,以人类、小鼠或大鼠序列为基准(100%);
蛋白质同源性:MANE蛋白的氨基酸序列相似性比较,人类、小鼠或大鼠序列为基准(100%)
数据来源于:NCBI、ALLIANCE
疾病 & 突变
当前基因关联的疾病及其突变:
解剖分类:疾病发生的具体部位或关联的组织器官;
分值:基因与疾病之间的关联强度,分值越高,关联越紧密;
突变数量:基因与疾病相关的突变数量,括号内数字为同一Clinvar ID关联的数据总量,点击数字即可查看突变详情。
数据来源:Clinvar
转录本 & 蛋白质
当前基因的转录本概览,可切换表格和图形展示:
表格:统计对应转录本序列长度、外显子个数、CDS(编码区)长度、相关联的蛋白质序列ID、蛋白质序列长度等信息;
图形:对内含子、外显子以及UTR(非编码区)和CDS(编码区)进行直观展示。
MANE Select: 人类基因组中 NCBI 与 EBI 一致定义的代表性转录本
MANE Plus Clinical: 人类基因组中,在临床报告中具有重要意义的补充转录本
RefSeq Select: NCBI 挑选出的具有代表性的参考转录本(主要用于小鼠或其他无 MANE 标签的物种)
数据来源:NCBI
基因表达量
当前基因在各类组织及细胞中的RNA表达水平,允许用户根据组织类型、具体的表达量数值或字母顺序进行排序。
数据来源:NCBI
蛋白相互作用
当前基因存在相互作用的基因,包括以下内容:
作用蛋白、靶蛋白:区分互作链中的上游作用蛋白与下游靶蛋白;
调控方式:四种调控类型:
[] 上调
[] 下调
[] 复合体形成
[] 未知
实线代表直接作用,虚线表示间接作用;
作用蛋白、靶蛋白:区分互作链中的上游作用蛋白与下游靶蛋白;
调控细节:表明互作后蛋白数量或活性的变化;
作用机制:阐述互作导致的功能转变;
氨基酸残基:指出参与互作的特定氨基酸残基,并指明研究物种、组织或细胞;
参考文献:汇总并展示相关互作研究的报道文献及其概览,并指明研究物种、组织或细胞;
分值:通过分值量化互作紧密程度,分数越高,联系越紧密。
数据来源:Signor、PubMed
相关模型
当前基因相关的小鼠模型,点击模型名称,可查看模型详情。
数据来源:MGI
靶点药物
与当前基因相关药物,展示CAS号、研发与临床试验状态。
数据来源:Clinical Trials
文献报道
当前基因最为密切相关的文献,可按年份、文献类型筛选,并可根据影响因子排序。
数据来源:Uniprot、PubMed
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