CyageniCyagen
首页AI 智能助手
工具集
数据库
资源
关于我们
AI 工具
RNA剪接预测模型
ASO设计模型
致病性预测模型
生信工具
序列查看
突变查看
抗体发现
靶点洞察
计算分析
数据库
基因库
疾病库
模型库
突变库
学习
学习中心
探索
iCyagen
赛业生物
OriCell®细胞生物学
AbSeek®智能抗体计算平台
联系
联系我们
中文
EN
人类
BRCA1 - BRCA1 DNA Repair Associated
别称:
BRCAI
|
BRCC1
|
BROVCA1
|
FANCS
|
IRIS
|
PNCA4
|
PPP1R53
|
PSCP
|
RNF53
基础信息
物种序列比对
疾病 & 突变
转录本 & 蛋白质
基因表达量
蛋白相互作用
相关模型
靶点药物
文献报道
This gene encodes a 190 kD nuclear phosphoprotein that plays a role in maintaining genomic stability, and it also acts as a tumor suppressor. The BRCA1 gene contains 22 exons spanning about 110 kb of DNA. The encoded protein combines with other tumor suppressors, DNA damage sensors, and signal transducers to form a large multi-subunit protein complex known as the BRCA1-associated genome surveillance complex (BASC). This gene product associates with RNA polymerase II, and through the C-terminal domain, also interacts with histone deacetylase complexes. This protein thus plays a role in transcription, DNA repair of double-stranded breaks, and recombination. Mutations in this gene are responsible for approximately 40% of inherited breast cancers and more than 80% of inherited breast and ovarian cancers. Alternative splicing plays a role in modulating the subcellular localization and physiological function of this gene. Many alternatively spliced transcript variants, some of which are disease-associated mutations, have been described for this gene, but the full-length natures of only some of these variants has been described. A related pseudogene, which is also located on chromosome 17, has been identified. [provided by RefSeq, May 2020]
相关ID:
NCBI: 672
|
ENSEMBL: ENSG00000012048
|
HGNC: 1100
|
UNIPROT: P38398
|
OMIM: 113705
基础信息
基因类型
NCBI
转录本
外显子
基因长度
分子量
基因突变
相关疾病
相关模型
参考文献
Protein-coding
672
368
31
126033 bp
207.72
14736
致病: 3724
可能致病: 232
可能良性: 2698
良性: 818
不确定: 7264
0
31
108
BRCA1遗传学信息(-)
GRCh38
物种序列比对
对比当前基因在大鼠、小鼠和人类中的同源基因的差异:
基因长度:基因所在染色体及和该基因所含碱基数;
转录本长度:基因的MANE (The Matched Annotation from the NCBI and EMBL-EBI)转录本ID及其对应的序列长度;
蛋白质长度:列出了基因的MANE蛋白质ID及其长度信息;
外显子数量:基因MANE转录本包含外显子数量;
CDS同源性:编码MANE蛋白的CDS剪接序列相似性比较,以人类、小鼠或大鼠序列为基准(100%);
蛋白质同源性:MANE蛋白的氨基酸序列相似性比较,人类、小鼠或大鼠序列为基准(100%)
数据来源于:NCBI、ALLIANCE
疾病 & 突变
当前基因关联的疾病及其突变:
解剖分类:疾病发生的具体部位或关联的组织器官;
分值:基因与疾病之间的关联强度,分值越高,关联越紧密;
突变数量:基因与疾病相关的突变数量,括号内数字为同一Clinvar ID关联的数据总量,点击数字即可查看突变详情。
数据来源:Clinvar
转录本 & 蛋白质
当前基因的转录本概览,可切换表格和图形展示:
表格:统计对应转录本序列长度、外显子个数、CDS(编码区)长度、相关联的蛋白质序列ID、蛋白质序列长度等信息;
图形:对内含子、外显子以及UTR(非编码区)和CDS(编码区)进行直观展示。
MANE Select: 人类基因组中 NCBI 与 EBI 一致定义的代表性转录本
MANE Plus Clinical: 人类基因组中,在临床报告中具有重要意义的补充转录本
RefSeq Select: NCBI 挑选出的具有代表性的参考转录本(主要用于小鼠或其他无 MANE 标签的物种)
数据来源:NCBI
基因表达量
当前基因在各类组织及细胞中的RNA表达水平,允许用户根据组织类型、具体的表达量数值或字母顺序进行排序。
数据来源:NCBI
蛋白相互作用
当前基因存在相互作用的基因,包括以下内容:
作用蛋白、靶蛋白:区分互作链中的上游作用蛋白与下游靶蛋白;
调控方式:四种调控类型:
[] 上调
[] 下调
[] 复合体形成
[] 未知
实线代表直接作用,虚线表示间接作用;
作用蛋白、靶蛋白:区分互作链中的上游作用蛋白与下游靶蛋白;
调控细节:表明互作后蛋白数量或活性的变化;
作用机制:阐述互作导致的功能转变;
氨基酸残基:指出参与互作的特定氨基酸残基,并指明研究物种、组织或细胞;
参考文献:汇总并展示相关互作研究的报道文献及其概览,并指明研究物种、组织或细胞;
分值:通过分值量化互作紧密程度,分数越高,联系越紧密。
数据来源:Signor、PubMed
相关模型
当前基因相关的小鼠模型,点击模型名称,可查看模型详情。
数据来源:MGI
靶点药物
与当前基因相关药物,展示CAS号、研发与临床试验状态。
数据来源:Clinical Trials
文献报道
当前基因最为密切相关的文献,可按年份、文献类型筛选,并可根据影响因子排序。
数据来源:Uniprot、PubMed
Cyagen
首页
工具
数据库
资源
关于我们
邮箱:icyagen-support@cyagen.com
电话:+86 18620792549
地址:广州市黄埔区香雪八路98号
欢迎关注我们
iCyagen
赛业(苏州)生物科技有限公司 Copyright © 2024 Cyagen Biosciences. All rights reserved. 备案号:苏ICP备16016913号-18
隐私条款
用户协议
回到顶部